贵公司是增值税一般纳税人吧？若是，可参考下面的思路来进行处理：
1 贵佘司自己购料：
借：原材料
应交税费——应交增值税（进项税额）
贷：应付账款（银行存款）
2 发料到工厂：
借：委托加工物资——原材料
贷：原材料
3 收回委托加工后的产品，并取得加工发票：
借：委托加工物资——加工费
应交税费——应交增值税（进项税额）
贷：应付账款
借：库存商品
贷：委托加工物资——原材料
——加工费
注：第3项也可合并处理。
1、确认加工收入时 借：应收账款 贷：主营业务收入 贷：应交税金--增值税 2、因不良产品质量问题扣款，可以冲销收入，如，加工收入100000元，扣款10000元。
借：银行存款 90000 贷：应收账款 90000 同时，冲减扣款 借：应收账款 10000（红字） 贷：主营业务收入（10000/1.03）9708.74（红字） 贷：应交税金--增值税 291.26（红字） 3、属于产品检查工时费扣款，扣款费用计入加工成本或销售费用科目。即： 借：生产成本（或销售费用） 贷：应收账款。
委外加工，费用按两块计算
一是加工费
加工费不应该按发出的计算，而应该按加工完成的计算
二是赔偿款
赔偿款直接按损失计算，最后与加工费合计后办理结算。
举例来说：
你发出1000件去加工，加工单价1元
现在收回900件加工好的，计算加工费900元
收回无法加工或加工费的80件，不计加工费，也不需赔偿
遗失20件，按成本单价计算为5元每件，共需赔偿100元
两者合计，只需支付900-100=800元
现在900件里有50件因加工原因，发生损耗150件，改制费用为300元
这个应该扣加工费
则你支付款为800-300=500元。
这是正常业务操作的办法
但这个不是国家法规，可以强制执行，最终是要靠市场行为来约束的
所以，当发生纠纷时，需要双方协商，按协商结果处理。
受托加工业务包括了生产与销售两个重要的过程，同时也包括对客户发来的物料的管理（仅仅是数量上的管理，不做会计处理） 这篇博文主要介绍受托加工业务的在供应链中的相关模块的处理流程，由于本人知识及经验的局限性，在生产管理部分没有怎么涉及，也希望广大朋友能够补充：一.基础资料准备.这个阶段主要涉及仓库及物料等主要的资料的设置.1.1仓库设置[目的]新增两个仓库资料，分别为受托加工仓与受托产品仓，对物料分仓库进行单独管理.[操作路径]系统设置---基础资料----公用资料-----仓库[快速进入码][49012] 图1（受托加工仓，仓库类型为代管仓） 图2（受托产品仓，仓库类型为普通仓） 1.2物料设置（主要包括客户送来的物料及加工后的成品）[目的]新增两个物料，分别为材料（客户送来的待加工的物料）及成品（加工完成后的产品）[操作路径]系统设置----基础资料----公用资料-----物料[快速进入码] 49011 图3（材料，物流资料中科目的设置无关仅要）5.
图4（成品，注意相关会计科目的设置） 二.单据处理 这部分主要包括如下的三部分内容：受加工材料的管理，产品的完成入库及成本核算及产品的销售业务处理.2.1受托加工材料的管理2.1.2企业收到客户送来的材料，进入入库处理[目的]增加一个受托加工材料入库单[操作路径]供应链---仓存管理---受托加工----受托加工材料入库-新增[快速进入码]18028[注意点]收料仓库为受托加工仓（代管仓） 图5受托加工材料入库单（新增）2.1.2生产过程中领用客户的材料[目的]增加一个受托加工领料单[操作路径]供应链---仓存管理----受托加工----受托加工领料单-新增[快速进入码]18030[注意点]发料仓库为受托加工仓（代管仓） 受托加工领料单（新增） 2.2 受托加工产品完工入库及加工成本核算（核算生成过程中发生的各种成本，包括人工费及制造费用）2.2.1 受托加工产品完工产库[目的]增加一个产品入库单[操作路径]供应链----仓存管理----验收入库----产品入库新增[快速进入码]18003[注意点]收货仓为受托产品仓（普通仓） 图7产品入库单新增2.2.2核算受托加工产品生产过程中发生了成本总额（包括人工费及制造费，不包括材料费用.）[目的]核算受托产品入库成本[操作]供应链---存货核算----入库核算----自制入库核算[快速进入码]20007[关键点]在受托加工材料对应的单价处填写加工成本. 图8 产品入库核算 2.3受托加工产品的销售2.3.1 受托加工产品销售出库[目的]新增一个销售出库单[操作路径]供应链---销售管理-----销售出库----销售出库单—新增[快速进入码]15027[技巧]可以通过产品入库单关联生成销售出加单[注意点]发货仓库为受托产品仓（普通仓库） 图9 销售出库单（新增）2.3.2 开具销售发票[目的]新增一张销售专用发票[操作路径]供应链---销售管理----销售发票----销售发票新增[快速进入码]15031[注意点]此处的单价为向客户收取的价格，而非加工成本[技巧]可以通过销售出库单关联生成销售发票 图10销售发票（新增）2.3.3 销售出库单与发票进入钩稽2.3.4 销售出库成本的核算[目的]核算销售出库单上的成本数据[操作路径]供应链----存货核算----出库核算----产品出库核算[快速进入码]20018 图11 销售出库成本核算 三.业务单据的凭证制作. 由于受托加工的材料放在代管仓进入管理（见图1），所有材料的入加及领用都将不进行成本的核算，因此也无须进入生成凭证.需要进行会计处理的单据有产品入库单，销售出库单及销售发票.3.1凭证模型的设置[目的]检查或设置相关业务单据的凭证模板，这是生成凭证的前提.[操作路径]供应链---存货核算-----凭证管理----凭证模板[快速进入码]20054 图12 产品入库凭证模板的设置 图13 销售出库的凭证模板的设置 图14 销售发票的凭证模型的设置 3.2生成凭证[目的]按照事务类型（单据类型）生成相应的凭证[操作路径]供应链----存货核算---凭证管理----生成凭证[快速进入码]20055 图15 产品入库的凭证 图16 销售出库的凭证 图17 销售发票的凭证
